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沃特世RNA分析工具再升级,MAP Sequence 2.0助力mRNA及sgRNA序列分析

更新时间:2026-01-12      点击次数:39


近年来,以长链RNA为基础的治疗药物(CRISPR sgRNA、mRNA)和疫苗发展迅速,这类RNA的核苷酸长度从100个到数千个不等,与长度相近的蛋白质类似,仅通过完整质量分析无法全面了解其特性。需要借助基于酶切的策略来确认序列,并评估靶向修饰和非预期修饰。

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全新的MAP Sequence 2.0 App能够通过LC-MS分析寡核苷酸序列图谱,确认长链RNA分子的完整性、线性序列和修饰情况。用户通过序列特异性RNase酶对RNA进行酶切,生成可预测的酶切寡核苷酸产物后,可通过LC-MSE对这些酶切寡核苷酸进行分析,构建寡核苷酸图谱。这一过程类似于酶切蛋白质后的肽图分析。而MAP Sequence信息学工具会利用质量和碎片信息,将图谱中的峰与酶切片段进行匹配。

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图1. 使用MAP Sequence 2.0版比较sgRNA经三种酶(RapiZyme Cusativin、RapiZyme MC1和RNase T1)酶解后获得的序列覆盖率。合并序列覆盖率表明,通过工作流程中概述的复合酶解方法,可以实现沃特世sgRNA的完整序列表征。

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MAP Sequence 2.0 App具有以下优势功能:

01

能够原生处理来自 BioAccordXevo G3 QTofXevo MRT系统的数据,可以根据自身对可用性、灵敏度和质量准确度的需求选择合适的平台。

02

具备整合多次图谱分析结果,和灵活支持多种酶切策略的能力,为实现高可信度的高序列覆盖率提供了较大可能。

03

提供多种用于数据审查和报告的数据及结果可视化工具,能够清晰、简洁地呈现图谱中单个酶切寡核苷酸的结果,以及整个分子图谱的汇总结果。

04

搭载在waters_connect质谱软件平台,作为一款合规软件,waters_connect可部署于产品及工艺研发阶段的RNA表征工作,也可用于构建经验证的常规分析方法,在受监管的生产与产品放行流程中监控这些关键属性。

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